目前重庆轨道交通6号线可以和1号线、3号线、5号线、环线、9号线、10号线和国博线7条线路换乘。换乘站点一共有9个，分别是：
1、上新街：与环线换乘；
2、小什字：与1号线换乘；
3、江北城：与9号线换乘；
4、五里店：与环线、9号线换乘；
5、红土地：与10号线换乘；
6、红旗河沟：与3号线换乘；
7、大龙山：与5号线换乘；
8、冉家坝：与环线、5号线换乘；
9、礼嘉：与国博线换乘。
重庆轨道交通6号线全部站点
重庆轨道交通6号线有一共有28个地铁站，分别为：茶园站、邱家湾站、长生桥站、刘家坪站、上新街站、小什字站、大剧院站、江北城站、五里店站、红土地站、黄泥塝站、红旗河沟站、花卉园站、大龙山站、冉家坝站、光电园站、大竹林站、康庄站、九曲河站、礼嘉站、金山寺站、曹家湾站、蔡家站、向家岗站、龙凤溪站、状元碑站、西南大学站、北碚站。
重庆轨道交通6号线将成为市民往返穿梭北碚、渝北、江北等地的一条“快速干道”，不仅对市民出行提供便利，还将对北碚经济社会发展带来巨大商机，对北碚的城市规划也具有重要意义。